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• Type de fichierFichier d'alignement compressé
• Binaire
• Qu'est-ce qu'un fichier CRAM?
• À propos des fichiers CRAM

Type de fichierFichier d'alignement compressé

Développeur	EBI
Popularité	3.0 (1 Vote)
Catégorie	Fichiers de données
Format	X binaire Binaire Ce fichier est enregistré dans un format binaire, ce qui nécessite un programme spécifique pour lire son contenu.

Qu'est-ce qu'un fichier CRAM?

Format de fichier d'alignement compressé développé par EBI, une station externe du laboratoire européen de biologie moléculaire; stocke les alignements de lecture de séquences d'ADN courtes générés à partir d'aligneurs de lecture courts tels que BWA, BBMap et BLAT. Plus d'information

Le format de fichier CRAM est similaire au format de fichier BAM (Binary Alignment / Map), mais offre une meilleure compression des fichiers et un format de conteneur binaire restructuré orienté colonne. Alors que les volumes de données dans le domaine des logiciels génétiques augmentent, le format CRAM a été conçu pour réduire l'empreinte de disque des données d'alignement.

Un alignement de lecture courte est le processus de déchiffrement d'où provient une séquence dans le génome. Cela peut être difficile car le génome de référence est plutôt grand et vous ne recherchez pas toujours des correspondances exactes dans le génome de référence. Les aligneurs de lecture courts sont utilisés pour rechercher d’énormes séquences de correspondances et de quasi-correspondances. Comme les séquences sont si volumineuses, la compression fournie par des formats tels que CRAM est nécessaire pour que les tailles de fichier restent gérables.

TÉLÉCHARGEMENT GRATUIT Get File Viewer pour Android Programmes ouvrant des fichiers CRAM

les fenêtres

Samtools

Mis à jour le 1/11/2016

À propos des fichiers CRAM

Notre objectif est de vous aider à comprendre ce qu'est un fichier avec le suffixe * .cram et comment l'ouvrir.

Le type de fichier Compressed Alignment, la description du format de fichier et les programmes Windows répertoriés sur cette page ont été individuellement recherchés et vérifiés par l'équipe FileInfo. Nous visons une précision de 100% et ne publions que des informations sur les formats de fichiers que nous avons testés et validés.

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